DIAGNOSIS IN PLANT PATHOLOGY

Anno accademico 2026/2027 - Docente: VITTORIA CATARA

Risultati di apprendimento attesi

Al termine del corso lo studente sarà in grado di conseguire i seguenti risultati di apprendimento:

Conoscenza e capacità di comprensione

Lo studente acquisirà una conoscenza approfondita del processo diagnostico in patologia vegetale, dalla valutazione dei sintomi e dei segni di malattia fino al rilevamento, all'identificazione e alla caratterizzazione dei patogeni vegetali, inclusi virus, viroidi, batteri, funghi e oomiceti. Acquisirà inoltre conoscenze sui principi e sulle applicazioni delle principali metodologie diagnostiche tradizionali e avanzate, sui protocolli ufficiali di diagnosi e sul quadro normativo della sanità delle piante.

Capacità di applicare conoscenza e comprensione

Lo studente sarà in grado di applicare procedure diagnostiche per il campionamento, l'isolamento, il rilevamento e l'identificazione dei patogeni vegetali mediante approcci biologici, sierologici e molecolari. Saprà utilizzare e interpretare protocolli diagnostici e selezionare le metodologie più appropriate in funzione del patogeno, del materiale vegetale e degli obiettivi dell'analisi.

Autonomia di giudizio

Lo studente svilupperà la capacità di valutare criticamente dati e risultati diagnostici, riconoscendo vantaggi e limiti delle diverse metodologie disponibili. Sarà in grado di scegliere il percorso diagnostico più appropriato e formulare conclusioni scientificamente fondate in differenti contesti fitosanitari.

Abilità comunicative

Lo studente acquisirà la capacità di utilizzare una terminologia scientifica appropriata e di comunicare risultati, procedure e conclusioni diagnostiche attraverso presentazioni orali e discussioni scientifiche.

Capacità di apprendimento

Lo studente svilupperà la capacità di aggiornare autonomamente le proprie conoscenze mediante la consultazione critica della letteratura scientifica, dei protocolli diagnostici ufficiali e delle fonti normative nazionali e internazionali, con particolare attenzione alle innovazioni tecnologiche nel settore della diagnostica fitopatologica.


Modalità di svolgimento dell'insegnamento

l corso combina lezioni frontali, attività di laboratorio e discussione di casi studio.

Lezioni (21 ore): forniscono le basi teoriche della diagnosi delle malattie delle piante, dei flussi di lavoro diagnostici, dei metodi di rilevamento e identificazione dei patogeni e della normativa in materia di salute delle piante.

Attività pratiche (42 ore): comprendono esercitazioni di laboratorio, dimostrazioni di protocolli diagnostici, analisi di casi studio, seminari e attività finalizzate a simulare reali scenari diagnostici.

Quando possibile, saranno organizzate visite tecniche presso laboratori diagnostici, servizi fitosanitari o aziende del settore agroalimentare, al fine di consentire agli studenti di confrontarsi con contesti professionali dedicati alla diagnosi fitopatologica.

Qualora il corso venga erogato in modalità mista o a distanza, le attività sopra descritte potranno essere opportunamente adattate per garantire la piena coerenza con gli obiettivi formativi e i contenuti previsti dal programma del corso.

Prerequisiti richiesti

Contenuti degli insegnamenti dei corsi triennali

Frequenza lezioni

La frequenza alle lezioni non è obbligatoria, ma fortemente consigliata poiché facilita il processo di apprendimento e contribuisce al pieno raggiungimento degli obiettivi formativi del corso.

Contenuti del corso

Il corso fornisce una formazione teorica e pratica sulla diagnosi delle malattie delle piante, dal processo diagnostico, dall'osservazione della sintomatologia fino alla rilevazione, identificazione e caratterizzazione degli agenti patogeni.

Gli argomenti trattati comprendono:

  1. Principi della diagnosi delle malattie delle piante e percorsi diagnostici.
  2. Sintomatologia, valutazione delle malattie e strategie di campionamento.
  3. Isolamento e identificazione di batteri e funghi fitopatogeni.
  4. Saggi biologici e prove di patogenicità.
  5. Tecniche sierologiche per la rilevazione degli agenti patogeni.
  6. Approcci di diagnostica molecolare, inclusi i metodi basati sulla PCR.
  7. Tecnologie diagnostiche avanzate, tra cui DNA barcoding, genomica, metagenomica e sequenziamento ad alta processività (High-Throughput Sequencing, HTS).
  8. Selezione, validazione e confronto dei metodi diagnostici.
  9. Cenni di Normativa fitosanitaria.
  10. Protocolli diagnostici ufficiali e casi studio.

Testi di riferimento

Il docente fornirà materiale di studio in Inglese: schemi e appunti di lezioni e di esercitazioni, sitografia e materiali online disponibili nei siti dell'America Phytopathological Society e British Society for Plant Pathology, European and Mediterranean Plant Protection Organization (EPPO).

Programmazione del corso

 ArgomentiRiferimenti testi
1Introduzione alla diagnostica fitopatologica:    Diagnosi, rilevamento, identificazione e caratterizzazione dei patogeni vegetali. Workflow diagnostico. Organizzazioni fitosanitarie e protocolli ufficiali di diagnosi. Materiale fornito dal docente
2Sintomatologia e campionamento:    Anamnesi, sintomi, sindromi e segni di malattia. Diagnosi sintomatologica e differenziale. Postulati di Koch. Valutazione della malattia, campionamento e registrazione dei dati. Materiale fornito dal docente
3Metodi diagnostici convenzionali :Isolamento di batteri e funghi fitopatogeni. Tecniche tradizionali di identificazione. Materiale fornito dal docente
4Diagnostica sierologica: Principi dell'interazione antigene-anticorpo. ELISA, immunofluorescenza, immunoblotting e tecniche correlate. Sensibilità, specificità e interpretazione dei risultati. Materiale fornito dal docente
5Diagnostica molecolare: Estrazione e analisi degli acidi nucleici. PCR, RT-PCR, Real-Time PCR e tecniche derivate. Applicazioni nel rilevamento e nell'identificazione dei patogeni. Materiale fornito dal docente
6Saggi biologici e prove di patogenicità:Verifica della patogenicità.Piante indicatrici e saggi biologici.Identificazione di razze, patotipi e varianti.Materiale fornito dal docente
7Tecnologie diagnostiche avanzate:DNA barcoding e MLST.Genomica, metagenomica e sequenziamento ad alta processività (HTS).Biosensori e strumenti di diagnostica portatile Materiale fornito dal docente
8Attività pratiche e casi studio: Esercitazioni di laboratorio. Analisi di casi studio e problem solving. Discussione di scenari diagnostici reali. Materiale fornito dal docente

Verifica dell'apprendimento

Modalità di verifica dell'apprendimento

La votazione segue il seguente schema (tabella riportata in italiano e in inglese):

Voto

Italiano

Inglese

Non idoneo

Conoscenza e comprensione argomento: significative carenze e imprecisioni

Capacità di analisi e sintesi: irrilevanti, frequenti generalizzazioni

Utilizzo di referenze: completamente inappropriato

Knowledge and understanding of the topic: significant shortcomings and inaccuracies

Ability to analyze and synthesize: irrelevant with frequent generalizations

Use of references: completely inappropriate

18-20

Conoscenza e comprensione argomento: molto modesto, imperfezioni evidenti

Capacità di analisi e sintesi: appena sufficienti

Utilizzo di referenze: appena appropriato

Knowledge and understanding of the topic: very modest with evident imperfections

Analysis and synthesis skills: barely adequate

Use of references: just appropriate

21-23

Conoscenza e comprensione argomento: conoscenza poco più che sufficiente

Capacità di analisi e sintesi: discreta capacità di analisi e sintesi, argomenta in modo logico e coerente

Utilizzo di referenze: utilizza le referenze standard

Knowledge and understanding of the topic: knowledge is slightly above the minimum acceptable level

Ability to analyze and synthesize: a fair bility to analyze and synthesize information, presenting arguments in a logical and coherent manner

Using references: use standard references

24-26

Conoscenza e comprensione argomento: conoscenza buona

Capacità di analisi e sintesi: ha buone capacità di analisi e di sintesi buone, gli argomenti sono esposti coerentemente

Utilizzo di referenze: utilizza le referenze standard

Knowledge and understanding of the topic: good knowledge

Analysis and synthesis skills: good analytical and synthesis abilities, arguments are presented consistently

Using references: use of standard references

27-29

Conoscenza e comprensione argomento: conoscenza più che buona

Capacità di analisi e sintesi: ha notevoli capacità di analisi e di sintesi

Utilizzo di referenze: ha approfondito gli argomenti

Knowledge and understanding of the topic: knowledge more than good

Ability to analyze and synthesize: considerable abilities of analysis and synthesis

Use of references: the topic has been explored in depth

30-30 e lode

Conoscenza e comprensione argomento: conoscenza ottima

Capacità di analisi e sintesi: ha notevoli capacità di analisi e di sintesi

Utilizzo di referenze: significativi approfondimenti

Knowledge and understanding of the topic: excellent knowledge

Ability to analyze and synthesize: excellent abilities of analysis and synthesis

Use of references: important insights

La verifica dell’apprendimento potrà essere effettuata anche per via telematica, qualora le condizioni lo dovessero richiedere. A garanzia di pari opportunità e nel rispetto delle leggi vigenti, gli studenti interessati possono chiedere un colloquio personale in modo da programmare eventuali misure compensative e/o dispensative, in base agli obiettivi didattici ed alle specifiche esigenze. È possibile rivolgersi anche al docente referente CinAP (Centro per l’integrazione Attiva e Partecipata — Servizi per le Disabilità e/o DSA) del Dipartimento (https://www.cinap.unict.it/content/referenti).

Esempi di domande e/o esercizi frequenti

  • Illustrare un caso studio relativo a un patogeno regolamentato a scelta, descrivendo il percorso diagnostico adottato, dal campionamento alla conferma dell'identità del patogeno.

  • Definire i concetti di sintomo, segno e sindrome, fornendo un esempio di diagnosi differenziale per una malattia fogliare causata da diversi agenti eziologici.

  • Descrivere le principali fasi dell'isolamento e dell'identificazione di un fungo o di un batterio fitopatogeno a partire da tessuti vegetali sintomatici.

  • Illustrare i postulati di Koch e discuterne l'importanza e i limiti nel contesto della fitopatologia moderna.

  • Spiegare i concetti di sensibilità e specificità di un test diagnostico, evidenziandone il ruolo nell'interpretazione dei risultati.

  • Definire il concetto di DNA barcoding e descriverne le principali applicazioni nell'identificazione e caratterizzazione degli agenti fitopatogeni.